Ambas versiones de Honda Pilot incorporan la más avanzada tecnología Honda de Gestión Variable de Cilindros (VCM®), que ha sido diseñada para ayudar a mejorar la eficiencia en el consumo de combustible sin sacrificar el desempeño. Este sistema funciona activando y desactivando automáticamente el funcionamiento de los cilindros, lo que permite circular con tres, cuatro o los seis, dependiendo de las condiciones y necesidades de manejo.